Le projet LNMP dans sa totalité est estimé à 6,12 milliards d’€ (montant exprimé aux conditions économiques de janvier 2020) dont 2,04 milliards d’€ pour la phase 1 entre Montpellier et Béziers et 4,08 milliards d’€ pour la phase 2 entre Béziers et Perpignan.
Un « protocole d’intention de financement pour la réalisation de la phase 1 de la LNMP » a été signé le 22 janvier 2022 entre l’Etat, les collectivités locales et SNCF Réseau. Il prévoit un financement par l’Etat à hauteur de 40 %, par les collectivités locales à hauteur de 40 % et par l’Union européenne à hauteur de 20 %.
Le protocole fixe aussi une clause d’engagement pour la seconde phase du projet, et le principe d’une solidarité des collectivités pour le financement des deux phases du projet.
La société de financement de LNMP, créée par ordonnance du 2 mars 2022, gère la participation financière des collectivités territoriales au financement du projet. Carole Delga, présidente du Conseil régional d'Occitanie, a été élue à l'unanimité présidente du conseil d'administration de la Société de la LNMP lors du conseil d’administration d'installation de la société de la LNMP le 29 septembre 2022. Philippe Vidal, vice-président du département de l'Hérault délégué à l'aménagement du territoire a été vice-président.
Le projet LNMP fait partie des projets prioritaires de l’Union européenne car il s’agit d’un chainon manquant d’un corridor de transport entre l’Espagne et la Hongrie, au sein du réseau transeuropéen de transport (RTE-T).
A ce titre, le projet peut prétendre à d’importantes subventions de l’Union européenne pour les deux phases du projet, dans la continuité des subventions déjà obtenues. L’Union européenne a déjà contribué au financement des études préalables à l’enquête publique de la phase 1 via une subvention de 9,3 millions d’euros. Plus récemment en 2023, une subvention de 6,3 millions d’euros a été accordée par l’Union européenne pour les études préparatoires à la phase d’Avant-Projet Détaillé (APD) de la phase 1. L’Union européenne a souligné la qualité du dossier de demande de subvention déposé par SNCF Réseau, démontrant l’intérêt porté à la réalisation de ce chaînon manquant du Réseau transeuropéen de transports (RTE-T).
D’autres subventions européennes interviendront au fur et à mesure de l’avancement du projet et de la réalisation de ses différentes étapes.
